聖迷迭香書院與羅勒葉高校兩校大停電事件中，
雖然奇怪裝置爆炸只是虛驚一場順利解除，
但背後牽扯出更驚天的地下犯罪集團。
天才推理少女小綾認定幕後黑手就是怪盗輝夜姬，
於是鍥而不捨憑著微弱的線索去追查，
竟然給她發現一條秘道，通往一個秘密基地——
那是一個像是火車站加大型市集的建築物！
在這個犯罪基地裡，正進行很多嚴重的不法勾當，
當中最可怕的，更竟然有毒品生產和交易！
為了要向外界揭破這件事，眾人僭入敵方陣營，
登上了離開校園的火車，想向執法部門揭發事件。
豈料，小綾竟在此時發現，犯罪組織當中，
竟然包括她的爸爸？這下該怎麼辦？
是要大義滅親，還是要替父親隱瞞罪行？
